祖母の家で遺品整理をしていた音羽 庵(おとわ いおり)は、ちょっとした勘違いから怪しい二人組を家へ招き入れてしまう。
ゴーグルをつけた少女と黒いパーカーのフードを目深にかぶった男は、物に宿った魂の悩みを解決する、あやかし内閣あやかし府迷い子庁失せもの課の下部組織、失せもの相談所の全国どこでも支店、菫堂__略して菫堂(すみれどう)の職員だった。
お客様第一を理念に掲げすぎて、職務違反を繰り返す問題児揃いの政府機関。理解すら追いつかないし、できればなるべく関わりたくない__そう思っていた庵だったが、気づいたときには何故か菫堂でアルバイトをすることになっていて__!?