第三次大戦前夜、北極海にある人跡未踏の凍てついた島で、奇妙な古代遺跡が発見された。そこから回収された「生々しい死体」が、時代をかえることになる。
やがて南北対立と世界の貧困化はついに深刻な事態に陥り、世界はまたも業火に包まれた。
数年に及ぶ多発地域核紛争で世界人口は半減、文明は徹底して破壊された。生き残った国も国家としての体裁を保つことすら出来ない。
戦争前、脆弱な国際連合は瓦解し、かわって武断主義的な国際連邦が成立していた。その連邦は後輩した地球を統治すべく、各地に駐屯軍をおき、特別武装治安士リッターに事実上治安維持を一任している。全世界的規模の軍政だが、各地で武装勢力が跋扈していた。
大戦後、不思議な能力を持つ超人「ユーヴァーメンシェン」と呼ばれる少年少女たちが各地に出現した。彼らは国連に強制徴発、管理され、ほぼ全員が武装治安士リッターに選ばれている。
珍しい日本人リッターのミナセ・ユウは、難民キャンプの聖人といわれる「常人」の兄がいる。同じ母親の卵子から生まれたことは確かだ。しかしユウに限らずすべてのリッターは父親を知らない。
そして彼女ら猟騎士は、国際連邦から酷使され名誉を与えられつつ、常に危険視されていた。
そんな現実に絶望したのか、ある日ユウを育てたリッター長までもが、連邦を裏切って危険なムーヴメントの聖地を目指す。ユウは命令で、恩義あるトレーナーを追い詰めるが説得に失敗する。
かくて非道な連邦軍は裏切り者を射殺する。感情を表面化することすら許されないユウは、密かに苦悶した。国連はこの世界をどうしようと言うのか。自分たちはなんのために存在しているのか。
さらにある日ユウは、ミリーと言う少女の救出を命じられる。彼女は世界を脅かすムーヴメントの裏切り者で、その秘密と交換に保護を求めていた。ユウは上官ゾフィーを説得し、リッターの極秘基地「WOLF」に、情報提供者を召喚する。WOLFは決して探知されない、海中要塞だった。
しかしミリーは体内にミサイル誘導装置を仕組み、基地もろとも自爆を謀る。ユウは傷ついたミリーを追い詰めるが、射殺できない。結局冷静なゾフィーが、傷つきつつも「スパイ」を射殺した。
その後ユウは国連に追われる身となり、中央シベリアへと現れる。そこにはかつてのロシア地下要塞があり、その広大な迷宮が危険な「世界浄化ムーヴメント」の聖地と化していた。世界から集まった信者は、神人アピと呼ばれる不思議な教祖を崇拝し、世界の滅亡と再生を祈り続けている。
こうして連邦から追われるふりをして聖地「ウルティマ・トゥーレ」へ潜入したユウは、まんまと幹部に取り入ることが出来た。そしてついに「ムーヴメント」の恐るべき正体を知るにいたる。それは地球全人類の殲滅と、シェルター等で生き残った一千万人の信者による新たな人類史の創造だった。
その中心、神人アピは、一万年以上前に異世界文明によって遺伝的に「強化」された、まさに神に近い超人だった。 戦前凍てついた島から回収され、科学によって一万年の眠りから目覚めたのち、大戦後の混乱期に神と祭り上げられた。いまや危険な思想と小型核兵器を世界に拡散させ、地球の変革を唱える。そのアピ再生にかかわった老科学者ウルの捨て身の攻撃も、異星の技術に守られたアピには通じない。ユウは任務遂行、即ち危険な教祖アピ抹殺を執行しようとする。
しかしアピの口から、彼女たち超人種誕生の秘密が語られた。驚愕し躊躇するユウだが、もう時間はなかった。自らの感情を殺し、ユウは猟騎士リッターとしての義務を果たす。基地も崩壊する。
こうして危険な人類殲滅ムーヴメントは、多大な犠牲をはらって粉砕された。特殊任務後、ユウは生き残った少女フランマを連れて国際連邦本部へ出頭した。しかし世界の復興はまだまだ遠い。
自信を得たユウは超種族などではなく、一人の地球人として生きていく決意をする。
ミナセ・ユウ 16歳 数少ない女性猟騎士
ゾフィー・アイゼンハウアー 28歳 ユウの上官。連邦高等法務官
ミリー・カートライト 15歳 「ムーヴメント」を裏切った少女
「ドクトル」ツー・デァ・クライネキーファー 65歳 リッターの司令文官、科学者
アピ 年齢不詳 「導く者」と呼ばれる謎多き超人的カリスマ。ムーヴメントの中心。
フランマ 14歳ぐらい。「反アピ」パルチザンの果敢なトルキスタン系少女
ウル 80歳前後。パルチザンを率いる長老。アピの秘密を知り、その抹殺を願う。
コシロウ・タマキ 60歳、元日本国統合自衛部隊一等佐官、国連コミッショナー。
フリューゲルロス Flügelroß 汎用水空両用偵察、四人搭乗系武装全翼機。
クアドゥリガ Quadriga 四気筒全天候武装巡航二輪車。リッター専用のロボ・バイク。
パンツァーヘムト Panzerhemd 個人用軽量装甲服。温度調整可能な特殊戦闘服。
ハントゲシュッツ Handgeschütz 五十口径弾丸とロケット弾を発射する大型拳銃。
ブント Bundessturmwehr 国際連邦常備軍。B.S.W.難民と旧米軍、EU軍主体。
ユーヴァーメンシェン Übermenschen 超種族。世界大戦後その存在が顕現した若者達。
インク International Commonwealth 国際連邦。事実上世界の統治機関。