時はNE-2000X年。進化を次げた人類は地球をネットワーク化とした。
現実とネットを統一させた人類は、パソコンと同じようなウイルスも実体化したことに気づいていなかった。 彼等はホムンクルスと種族を名乗り上げ……個人の目的の為に
人類に脅威する。
そんなホムンクルスを倒す為に全世界に造られた組織が、ナイトメアジェネシスであり、この組織は
国家警察の人間達によって提案された対ホムンクルス特捜組織である。
又、物語は人間の心情と表と裏をテーマに展開する。
-お前が俺を殺したのか！- -生き延びて。其れから死になさい！- -世界はアンチテーゼなのよ-
私は何を造ろうとしているのか。争いへのアンチテーゼと人間ドラマを繋げ様としているのか？
答えは読者が知るだろう