20XX年、日本は２つの勢力が覇権を争い、日本全国で闘いをしていた。
１つは、絶大な力で新時代を創らんとする革命維新軍。
もう１つは、その力による覇権を阻止するべく日本政府が作り上げた日本真軍である。
始めは互角の戦いが繰り広げられていたが、革命維新軍の数と特殊能力の前に日本真軍は逆境にたたされていた。
そして、ついに日本真軍も特殊能力を持った新しいチームを編成した。
そのチームの名は…《真撰組》こうして革命維新軍と真撰組の壮絶な闘いが始まろうとしていた…。
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