苦闘の末、乱世を巻き起こす根源である妖聖と天草四郎を倒した同盟軍…しかし、妖聖という敵を失った武将たちは再び敵対色を強めて世界は再び乱世を迎えようとしていた…そんな中、死んだはずの妖聖による影響力で時間が歪み蘇った旧世代の武将たちがさらに戦場を混沌に陥れる…