部員数が足りず、廃部宣言をされた黒命学園オカルト部
部長である日高 海は部員の高田 唯斗、浅賀 美夜と共に部員を探すことに・・・
そんな中、今から50年前―当時悪霊退治として学園の裏山にある神社のおさめていた祠の封印が50年の時を経て、何者かの手によって解けてしまった。
３人をはじめとする黒命学園オカルト部で、部員を探すと共に次々と起こる怪奇事件を解決しながら封印を解いた犯人をつきとめていく。