御剣陽希、藤原いちご、
ジュノス・レイ・アンジェリークの3人は、
前回の事件のお礼として、
世界の守護者であるアンゼロットより
南の島へのバカンスに招待される。
もう一人の功労者であるユミルは
今回仕事で行けないということで、
代わりに御剣の幼馴染である皆月奈々花を
誘ったのだが、一行が遊んでいると、
突如自分たちの異変に気がついた。
なんと、自分たちの持っている
ナイトウィザードとしての力(クラス)が
他人の力と入れ違っているようだ。
そんなとき、事件の原因を突き止めて欲しいと
なぜか御剣に対し、アンゼロットより連絡が入る。
話によるとこの現象は、
エミュレイターの強制召喚が原因らしい。
事件の真相を求め、
御剣たちは島を捜索することになった。